Деятельность учреждений судебной медицины можно разделить на практическую экспертную и научно-исследовательскую.
Судебно-медицинская экспертиза в России находится в ведении Министерства здравоохранения и социального развития. Работа соответствующих учреждений регламентируется действующими нормами закона, ведомственными инструкциями и положениями. Все важные нормативные документы согласуются с Верховным судом, прокуратурой, МВД и другими заинтересованными министерствами и ведомствами.
Руководство судебной медициной осуществляет главный судебно-медицинский эксперт. Он же возглавляет Российский центр судебно-медицинской экспертизы, состоящий из бюро судебно-медицинской экспертизы и научно-исследовательского института судебной медицины.
На уровне субъектов Российской Федерации имеются бюро судебно-медицинской экспертизы. Организационно и методически они подчиняются Российскому центру судебной медицины, в административно-хозяйственном отношении – органам управления здравоохранения субъектов Федерации.
Все бюро судебно-медицинской экспертизы субъектов федерации имеют типовую структуру.
1. Отдел судебно-медицинской экспертизы трупов, в том числе судебно-гистологические отделения.
2. Отдел судебно-медицинской экспертизы потерпевших, обвиняемых и других лиц.
3. Отдел сложных судебно-медицинских экспертиз.
4. Организационно-методический отдел, в том числе отделения (кабинеты):
1) внедрения новых технологий;
2) программного и математического обеспечения;
3) кабинет по работе с жалобами и заявлениями.
5. Отделения судебно-медицинской экспертизы, в том числе:
1) Городские;
2) Районные;
3) Межрайонные.
6. Отдел судебно-медицинской экспертизы вещественных доказательств, в том числе отделения (лаборатории):
1) Судебно-биологическое;
2) Судебно-цитологическое;
3) Судебно-химическое;
4) Судебно-биохимическое;
5) Судебно-бактериологическое (вирусологическое);
6) Отделение медицинской криминалистики;
7) Спектральная лаборатория.
8) Судебно-медицинская молекулярно-генетическая лаборатория.
7. Другие структурные подразделения.
При некоторых бюро организованы центры научно-практической и методической работы по отдельным направлениям судебной медицины.