Основными принципами системы страхования вкладов являются:
1) обязательность участия банков в системе страхования вкладов, т. е. если банк осуществляет операции со средствами граждан, то он должен быть участником системы страхования их вкладов; при неисполнении банком этой обязанности Банк России применяет к нему меры ответственности. Так, согласно ст. 74 Федерального Закона от 10 июля 2002 г. № 86-ФЗ «О Центральном банке Российской Федерации (Банке России)» в случаях нарушения кредитной организацией федеральных законов Банк России имеет право требовать от кредитной организации устранения выявленных нарушений, взыскивать штраф в размере до 0,1 % минимального размера уставного капитала либо ограничивать проведение кредитной организацией отдельных операций на срок до 6 месяцев. Также он может отозвать у кредитной организации лицензию на осуществление банковских операций;
2) сокращение рисков наступления неблагоприятных последствий для вкладчиков в случае неисполнения банками своих обязательств, т. е. при отзыве либо аннулировании у банка лицензии на осуществление банковских операций каждый вкладчик получает право на возмещение по своим вкладам. Если имущества банка для финансирования мероприятий, связанных с деятельностью по обязательному страхованию вкладов не хватает, то возмещение может осуществляться за счет резервного фонда Правительства РФ;
3) прозрачность деятельности системы страхования вкладов. Данный принцип выражается в том, что вкладчики имеют право получать от банка информацию об участии банка в системе страхования вкладов, о размерах и порядке получения возмещения по вкладам, а банки, обязаны размещать информацию о системе страхования вкладов в доступных для вкладчиков помещениях банка на отдельных информационных стендах, в специальных папках или иным образом;
4) накопительный характер формирования фонда обязательного страхования вкладов за счет регулярных страховых взносов банков-участников системы страхования вкладов проявляется в том, что за счет ежеквартальных страховых взносов формируется фонд страхования вкладов, на который не может быть обращено взыскание по обязательствам РФ, ее субъектов, муниципальных образований, банков, иных лиц, кроме обязательств, возникших в связи с неисполнением им обязанностей по выплате возмещения по вкладам.