В соответствии со ст. 9 НК РФ, участниками налоговых правоотношений являются таможенные органы (федеральный орган исполнительной власти, уполномоченный по контролю и надзору в области таможенного дела, подчиненные ему таможенные органы РФ).
В соответствии с Указом Президента РФ от 9 марта 2004 г. № 314 «О системе и структуре федеральных органов исполнительной власти» Государственный таможенный комитет РФ был преобразован в Федеральную таможенную службу. Функции Государственного таможенного комитета по принятию нормативных правовых актов были переданы Министерству экономического развития и торговли РФ.
В соответствии с законодательством РФ функции по контролю и надзору в области таможенного дела, функции агента валютного контроля и специальные функции по борьбе с контрабандой, иными преступлениями и административными правонарушениями осуществляет Федеральная таможенная служба (федеральный орган исполнительной власти).
Система таможенных органов включает:
1) Федеральную таможенную службу РФ;
2) региональные таможенные управления РФ;
3) таможни РФ;
4) таможенные посты РФ.
Федеральная таможенная служба согласно ст. 403 Таможенного кодекса РФ от 28 мая 2003 г. № 61-ФЗ, осуществляет следующие основные функции:
1) таможенное оформление и таможенный контроль, создание условий, способствующих ускорению товарооборота через таможенную границу;
2) взимание таможенныхпошлин, налогов, антидемпинговых, специальных и компенсационных пошлин, таможенных сборов, контроль за правильностью исчисления и своевременностью уплаты указанных пошлин, налогов и сборов, принятие мер по их принудительному взысканию;
3) обеспечения соблюдения порядка перемещения товаров и транспортных средств через таможенную границу;
4) обеспечения соблюдения установленных в соответствии с законодательством РФ о государственном регулировании внешнеторговой деятельности и международными договорами РФ запретов и ограничений в отношении товаров, перемещаемых через таможенную границу;
5) обеспечение в пределах своей компетенции защиты прав интеллектуальной собственности;
6) ведение борьбы с контрабандой, иными преступлениями и административными правонарушениями в сфере таможенного дела, пресечение незаконного оборота через таможенную границу наркотических средств, оружия, культурных ценностей, радиоактивных веществ, видов животных и растений, находящихся под угрозой исчезновения, ихчастей и дериватов, объектов интеллектуальной собственности, других товаров, а также оказание содействия в борьбе с международным терроризмом и в пресечении незаконного вмешательства в аэропортах РФ в деятельность международной гражданской авиации.