Выделяют следующую классификацию расходов бюджета.
1. Функциональная классификация расходов бюджета Союзного государства является группировкой расходов бюджета Союзного государства и отражает направление бюджетных средств на выполнение основных функций Союзного государства.
Функциональная классификация подразделяется на несколько уровней: разделы, подразделы, целевые статьи, виды.
Функциональная классификация расходов бюджета Союзного государства: органы Союзного государства, функционирование Высшего государственного совета Союзного государства, функционирование законодательных (представительных) органов Союзного государства, функционирование исполнительных органов Союзного государства, международная деятельность, международное сотрудничество, реализация межгосударственных договоров в рамках Союзного государства, Международные культурные, научные и информационные связи, военно—техническое сотрудничество, обеспечение мобилизационной и вневойсковой подготовки, обеспечение деятельности отраслей для военно—технического сотрудничества Союзного государства, правоохранительная деятельность и обеспечение безопасности союзного государства, органы внутренних дел, органы государственной безопасности, органы пограничной службы, таможенные органы, прочие расходы в области правоохранительной деятельности и обеспечения безопасности Союзного государства, содействие научно—техническому прогрессу, фундаментальные исследования, разработка перспективных технологий и приоритетных направлений научно—технического прогресса, промышленность, энергетика и строительство, топливно—энергетический комплекс, конверсия оборонной промышленности, другие отрасли промышленности, строительство, архитектура, стандартизация и метрология, воспроизводство материально—сырьевой базы, сельское хозяйство и рыболовство, заготовка, переработка и хранение сельскохозяйственной продукции, охрана окружающей природной среды и природных ресурсов, водные, лесные ресурсы, охрана животного и растительного мира, гидрометеорология, картография и геодезия, прочие расходы в области окружающей природной среды и природных ресурсов, транспорт, связь и информатика, автомобильный транспорт, железнодорожный транспорт, воздушный транспорт, водный транспорт, прочие виды транспорта, связь, информатика (информационное обеспечение), предупреждение и ликвидация последствий чрезвычайных ситуаций и стихийных бедствий, совместная деятельность по преодолению последствий Чернобыльской катастрофы, прочие мероприятия по предупреждению и ликвидации последствий чрезвычайных ситуаций, гражданская оборона, образование, прочие расходы, не отнесенные к другим подразделам.
2. Экономическая классификация расходов бюджета Союзного государства является группировкой расходов бюджета по их экономическому содержанию
Экономическая классификация расходов разбивается на группы, подгруппы, статьи, подстатьи, элемента расходов.
3. Ведомственная классификация расходов бюджета Союзного государства, отражающая распределение бюджетных ассигнований по ведомствам Союзного государства.